16 июня 2016 года в конференц-зале КГУ им. И. Арабаева состоялось подписание протокола соглашения о создании Государственно-конфессионального совета при Государственной комиссии по делам религий Кыргызской Республики. Общую заинтересованность в построении собственной модели государственно-конфессиональных отношений выразили главы Бишкекской и Кыргызстанской епархии, Духовного управления мусульман Кыргызстана, буддийского общества «Чамсен», иудейской общины. Мероприятие состоялось при участии представителей Аппарата Президента КР, Государственного комитета национальной безопасности КР, МВД КР, Министерства образования и науки КР, Государственного агентства по делам молодежи, физической культуры и спорта КР, заинтересованного экспертного сообщества и др.
Государственно-конфессиональный совет является консультативным органом и будет содействовать реализации конституционного права граждан на свободу вероисповедания, координации совместных усилий государства и религиозных организаций в осуществлении и реформировании государственной политики в религиозной сфере.
Решения Государственно-конфессионального совета будут приниматься при участии полного состава членов совета и на основании консенсуса.